Maleš a jucat în cariera sa la Dinamo Zagreb, Lokomotiv Zagreb și HNK Rijeka, echipă pentru care a evoluat în ultimele 5 sezoane, bifând 127 de meciuri.
Mijlocașul de 29 de ani are trei trofee câștigate: două titluri de campion al Croației cu Dinamo Zagreb și HNK Rijeka, dar și o Cupă a Croației, obținută tot cu HNK Rijeka.