Din urna capilor de serie, echipele cele mai puternice erau Gyor, deţinătoarea Ligii Campionilor şi Buducnost Podgorica. Din urna a treia, era de evitat Vardar Skopje, iar din ultima grupă valorică FC Midjylland şi Ferencvaros.
Sistemul de desfăşurare al Ligii Campionilor s-a schimbat, asemănându-se cu cel de la Campionatul European. Primele trei echipe se califică în cele două grupele principale, care vor avea şase echipe. În această fază, echipele vor porni cu punctele acumulate în primele grupe. Primele patru echipe din cele două grupe se califică în sferturile de finală.
Componenţa grupelor:
Grupa A: Krim Ljubljana, Dinamo Volgograd, Hypo Viena, câştigătoarea turneului 1 preliminar (favorită Ferencvaros)
Grupa B: Buducnost, Thuringer, Vardar Skopje, câştigătoarea turneului 2 preliminar (favorită FC Midjylland)
Grupa C: Gyor, Viborg, Lokomotiva Zafreb, Saverhof
Grupa D: Larvik, HCM Baia Mare, Metz, MKS Lublin