Potrivit procurorilor acesta este vinovat de moartea unuia din copiii pe care i-a avut cu fiica sa, acesta murind la câteva zile de la naştere. Se pare că Fritzl ar fi ars apoi trupul bebeluşului, într-un cuptor. Acest capăt de acuzare este singurul pentru care Josef Fritzl poate fi condamnat la închisoare pe viaţă. Pedeapsa maximă pentru toate celelalte infracţiuni este de 15 ani de închisoare.
Potrivit avocatului său, Josef Fritzl poate de asemenea să conteste acuzaţia de sclavie, pentru că „nu este sigur că faptele sale indică aşa ceva”.
Avocatul luase în calcul, iniţial, să pledeze că Fritzl nu era în deplinătatea facultăţilor mintale, însă, în urma consultărilor psihiatrice a clientului său, acest lucru nu a fost posibil. El va pleda, astfel, pe „o personalitate puternic perturbată şi cel puţin dublă personalitate”.