Munaf a fost condamnat în lipsă la 10 ani de închisoare pentru terorism în anul 2008 și la plata unor despăgubiri de 2 milioane de euro pentru victimele sale. A fost adus în țară de autoritățile române abia în 2015 pentru a-și ispăși pedeapsa.
Acesta a jucat rolul de ghid pentru Ovidiu Ovidiu Ohanesian, Sorin Mișcoci și Marie Jeanne Ion, cei trei jurnaliști români răpiți în Irak în timpul unei vizite oficiale a președintelui Traian Băsescu.
Pe 28 martie 2005, cei trei au fost răpiți împreună cu Munaf, iar pentru ei s-a cerut o răscumpărare de 4 milioane de dolari.
Jurnaliști au fost eliberați pe 22 mai 2005, la capătul unei operațiuni ale cărei detalii au fost secretizate pentru 50 de ani, fiind apoi aduși în țară.
Mohammad Munaf a rămas atunci în custodia serviciilor speciale ale armatei americane, la Bagdad.
Alături de Mohammad Munaf, a fost condamnat pentru aceleași fapte și omul de afaceri sirian Omar Hayssam. Acesta este încarcerat în Penitenciarul Mărgineni și are de executat o pedeapsă de 23 de ani și patru luni.
În 2006, sirianul fusese eliberat pe baza diagnosticului de cancer în fază terminală, însă a fugit din ţară. El a fost adus ulterior în România după șapte ani.