Noua tulpină a apărut în februarie în Europa, a migrat rapid pe Coasta de Est a Statelor Unite și a fost dominantă în întreaga lume încă de la jumătatea lunii martie, au scris oamenii de știință, scrie LA Times.
În afară de răspândirea mai rapidă, aceasta poate face oamenii vulnerabili la o a doua infecție după o primă confruntare cu boala, a avertizat raportul.
Raportul de 33 de pagini a fost postat pe BioRxiv, un site web pe care cercetătorii îl folosesc pentru a-și împărtăși munca înainte de a fi revizuită, un efort pentru a urgenta colaborarea cu oamenii de știință care lucrează la vaccinuri sau tratamente COVID-19. Însă, cercetarea s-a bazat în mare parte pe secvența genetică a tulpinilor anterioare și s-ar putea să nu fie eficientă împotriva celei noi.
Mutația identificată în noul raport afectează vârfurile din exteriorul coronavirusului, care îi permit să intre în celulele respiratorii umane. Autorii raportului au spus că au simțit „o nevoie urgentă de avertizare timpurie”, astfel încât vaccinurile și medicamentele în curs de dezvoltare din întreaga lume să fie eficiente împotriva tulpinii mutate.
Oriunde a apărut noua tulpină, aceasta a infectat rapid mult mai multe persoane decât tulpinile anterioare care au explodat în Wuhan, China, iar în câteva săptămâni a fost tulpina predominantă existentă în unele țări, potrivit raportului. Dominanța noii tulpini asupra predecesorilor săi demonstrează că este mai infecțioasă, potrivit raportului, deși nu se știe cu exactitate de ce.
Cercetătorii au identificat nu mai puțin de 14 mutații
Coronavirusul, cunoscut de oamenii de știință ca SARS-CoV-2, a infectat peste 3,5 milioane de oameni din întreaga lume și a provocat peste 250.000 de decese COVID-19 de la descoperirea sa la sfârșitul anului trecut.
Raportul s-a bazat pe o analiză de calcul a mai mult de 6.000 de secvențe de coronavirus din întreaga lume, colectate de Inițiativa Globală pentru Împărtășirea tuturor datelor privind gripa, o organizație public-privată din Germania. Din nou, analiza a constatat că noua versiune se transforma în poziția de tulpină dominantă.
Echipa Los Alamos, asistată de oamenii de știință de la Duke University și Universitatea Sheffield din Anglia, a identificat 14 mutații. Aceste mutații au avut loc printre cele aproape 30.000 de perechi de baze de ARN despre care alți oameni de știință spun că alcătuiesc genomul coronavirusului. Autorii raportului s-au concentrat pe o mutație numită D614G, care este responsabilă de schimbarea vârfurilor virusului.
Formă mutantă a virusului se dezvoltă foarte rapid
„Povestea este îngrijorătoare, întrucât vedem o formă mutantă a virusului care se dezvoltă foarte rapid, iar în luna martie a devenit forma pandemică dominantă”, a scris liderul studiului Bette Korber, biolog computațional la Los Alamos, pe pagina sa de Facebook. „Când virusurile cu această mutație intră în populație, ele încep rapid să preia epidemia locală, astfel încât acestea devin mult mai transmisibile.”
În timp ce raportul Los Alamos este extrem de tehnic, Korber a exprimat câteva sentimente personale profunde despre implicațiile găsirii acestei noi tulpini în postarea ei de pe Facebook.
„Aceasta este o veste grea, dar vă rugăm să nu fiți descumpăniți. Echipa noastră de la LANL a putut documenta această mutație și impactul acesteia asupra transmiterii doar cu ajutorul unui efort global masiv de oameni, clinici și grupuri experimentale, care fac ca secvențele noi ale virusului (SARS-CoV-2) să fie disponibile în comunitățile locale cât mai repede. „
Korber, un absolvent al Cal State Long Beach, care a continuat să-și facă doctoratul în chimie la Caltech, s-a alăturat laboratorului în 1990 și și-a concentrat o mare parte din munca pe un vaccin contra HIV. În 2004, ea a câștigat premiul Ernest Orlando Lawrence, cea mai înaltă recunoaștere a Departamentului pentru Energie din SUA pentru realizarea științifică. Ea a contribuit cu o parte din banii câștigați pe premiu pentru a ajuta la stabilirea unui orfelinat pentru tinerele victime ale SIDA în Africa de Sud.
Raportul conține defalcări regionale de când a apărut prima tulpină de virus și cât a durat să devină dominantă.
Italia a fost una dintre primele țări care s-a confruntat cu noul virus în ultima săptămână a lunii februarie, aproape în același timp în care a apărut tulpina originală. Washingtonul a fost printre primele state care a fost lovit cu tulpina inițială, la sfârșitul lunii februarie, dar până la 15 martie tulpina mutată devenise dominantă. New York a fost lovit de virusul original în jurul datei de 15 martie, dar în câteva zile, tulpina mutantă a preluat-o. Echipa nu a raportat rezultatele pentru California.
Oamenii de știință de la organizațiile majore care lucrează la un vaccin sau medicamente au declarat pentru The Times că își pun speranțele în ceea ce privește dovezile inițiale că virusul este stabil și nu este probabil să mute modul în care face virusul gripal, necesitând un nou vaccin în fiecare an. Raportul Los Alamos ar putea susține această presupunere.
În cazul în care pandemia nu reușește să se estompeze pe măsură ce vremea se încălzește, avertizează studiul, virusul ar putea suferi mutații suplimentare chiar când se pregătesc primele tratamente medicale și vaccinuri. Fără a-și asuma riscul acum, eficacitatea vaccinurilor ar putea fi limitată. Unii dintre compușii aflați în laboratoarele de dezvoltare se presupune că se fixează pe vârf sau îi întrerup acțiunea. Dacă au fost concepute pe baza versiunii originale virusului, s-ar putea să nu fie eficiente împotriva noii tulpini de coronavirus, au avertizat autorii studiului.
„Nu ne putem permite să nu vedem aceaste mutație, în timp ce introducem vaccinurile și anticorpii în testele clinice”, a scris Korber pe Facebook. „Comunitatea științifică globală este implicată în găsirea de tratamente eficace și cooperăm între noi în moduri pe care nu le-am văzut niciodată în cei 30 de ani ai mei de muncă în domeniul științei.”
David Montefiori, un om de știință al Universității Duke, care a lucrat la raport, a spus că este primul care a documentat mutația în coronavirus ce pare să o facă mai infecțioasă.
„Un caz clasic al evoluției darwiniene”
Deși cercetătorii nu știu încă detaliile despre cum se comportă vârful mutant în interiorul corpului, în mod clar se întâmplă ceva care îi oferă un avantaj evolutiv față de predecesorul său și alimentează răspândirea rapidă a acestuia. Un om de știință l-a numit un „caz clasic al evoluției darwiniene”.
D614G crește în frecvență într-un ritm alarmant, ceea ce indică un avantaj major în raport cu tulpina originală Wuhan, fapt care permite o răspândire mai rapidă”, arată studiul.
„În Statele Unite, medicii au început să pună la îndoială dacă tulpinile noi ale virusului ar putea contabiliza diferențele în modul în care acesta a infectat, a îmbolnăvit și a ucis oamenii”, susține Alan Wu, profesor la UC San Francisco și care conduce laboratoarele de chimie clinică și toxicologie la Spitalul General din San Francisco.
Experții medicali au speculat în ultimele săptămâni că au văzut cel puțin două tulpini de virus în SUA, una predominantă pe Coasta de Est și alta pe Coasta de Vest, potrivit Wu.
„Căutăm să identificăm mutația”
„Căutăm să identificăm mutația”, a spus el, menționând că spitalul său a avut doar câteva decese din sutele de cazuri pe care le-a tratat, care este „o cu totul altă poveste decât cea auzită de noi despre ce se întâmplă la New York”.
Studiul Los Alamos nu indică faptul că noua versiune a virusului este mai letală decât originalul. Persoanele infectate cu tulpina mutată par să aibă încărcături virale mai mari. Însă autorii studiului de la Universitatea din Sheffield au descoperit că, dintr-un eșantion local de 447 de pacienți, ratele de spitalizare erau aproximativ aceleași pentru persoanele infectate cu versiunea originală a virusului.
Chiar dacă noua tulpină nu este mai periculoasă decât celelalte, ar putea totuși să complice eforturile de a pune sub control pandemia. Aceasta ar fi o problemă dacă mutația face virusul atât de diferit de tulpinile anterioare, încât persoanele care au imunitate la cele vechi, nu ar fi imune la noua versiune.
„Dacă acesta este într-adevăr problema, atunci ar putea face ca „indivizii să fie predispuși la o a doua infecție”, au scris autorii studiului.
Este posibil ca mutația să schimbe vârful într-un fel care ajută virusul să se „păcălească” sistemului imunitar, a spus Montefiori, care a lucrat la un vaccin anti-HIV timp de 30 de ani. „Este ipotetic. Îl privim foarte atenți.”